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Aunque la forma que actúa el SXF se está empezando a entender, se sabe que produce atrofia de las regiones hipocampo. El hipocampo es un área particularmente crítica para el aprendizaje en general dado que está vinculada tanto la memoria como la cognición espacial. Se trata de chicos que sufren déficit intelectual, y más del 80 por ciento tiene además trastornos de atención e hiperactividad y alrededor de un 20 una patología epiléptica convulsiva.
Una de las dificultades en el desarrollo de estrategias terapéuticas contra enfermedades neurodegenerativas como el SXF es el hiato que se produce entre los estudios experimentales con animales en el laboratorio y los que se realizan a nivel clínico con chicos que padecen estas patologías. Mientras los primeros se concentraran en los cambios a nivel molecular y poco en los conductuales, los segundos se focalizan casi exclusivamente en la conducta y no prestan atención a lo que ocurre a nivel cerebral.
Se trata de distintas técnicas complejas que permiten analizar diferentes aspectos del cerebro, como el volumen de las paredes laterales, la comunicación entre sus partes o percibir cambios a nivel de los neurotrasmisores.